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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
25/09/2009 |
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Data da última atualização: |
25/09/2009 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
ANTONIOLI-LUIZON, R.; FREITAS-ASTUA, J.; LOCALI-FABRIS, E. C.; MACHADO, M. A.; KITAJIMA, E. W. |
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Afiliação: |
Renata Antonioli-Luizon, APTA; Juliana Freitas-Ástua, CNPMF; Eliane Locali-Fabris, APTA; Marcos Antônio Machado, APTA; Elliot Watanabe Kitajima, ESALQ. |
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Título: |
Sequenciamento parcial do vírus da pinta verde do maracujazeiro (Passion fruit green spot virus-PFGSV. |
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Ano de publicação: |
2008 |
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Fonte/Imprenta: |
In: ENCONTRO NACIONAL DE PÓS-GRADUAÇÃO EM MICROBIOLOGIA, 3.; FÓRUM DOS COORDENADORES DOS PROGRAMAS DE MICROBIOLOGIA DA ÁREA DE CIÊNCIAS AGRÁRIAS, 5.; 2008, Jaboticabal.[ Programação...]. Jaboticabal: Funep, 2008 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O Brasil é o maior produtor mundial de maracujá, cultura essa afetada por um grande número de pragas e doenças. O vírus da pinta verde do maracujazeiro (Passion fruit green spot virus - PFGSV), transmitido pelo ácaro tenuipalpídeo Brevipalpus phoenicis, caracteriza-se pela formação de pequenas manchas verdes em frutos maduros e em folhas senescentes, e lesões necróticas em ramos que podem coalescer, produzindo anelamento e morte da planta. Exames ao microscópio eletrônico de transmissão (MET) revelam a presença de partículas baciliformes em cisternas do retículo endoplasmático e viroplasma denso no citoplasma. O diagnóstico da pinta verde é feito através dos sintomas típicos (o que é pouco confiável) ou de exames ao MET (o que é demorado e de alto custo) uma vez que que não estão disponíveis antissoros ou primers para teste sorológicos ou moleculares. Seu controle é essencialmente preventivo através do manejo químico do ácaro. Sendo assim, o objetivo desse trabalho foi sequenciar parcialmente o genoma do vírus a fim de obter subsídios para classificá-lo taxonomicamente, bem como desenvolver um método rápido e confiável para o diagnóstico da doença. O dsRNA de plantas de maracujá sintomáticas para pinta verde da região de Limeira-SP foi extraído, purificado e avaliado em de gel de agarose 1%. A síntese da 1º fita de cDNA foi realizada utilizando a enzima M-MLV-RT (Invitrogen) e random primers (Invitrogen). A 2º fita foi feita utilizando a enzima DNA Polimerase I (Promega). Após a síntese da 2º fita do cDNA, foi feita uma extração com fenol: clorofórmio para limpeza da amostra e o cDNA obtido foi ligado a adaptadores, amplificado por Nested PCR e purificado em gel LMP 1%. Os fragmentos purificados foram clonados em vetor pJET2.1 (Fermentas) e inseridos em celulas competentes de Escherichia coli da linhagem DH5a por choque térmico. Os clones transformantes foram coletados em microplacas contendo meio CG acrescido de ampicilina e após seu crescimento o DNA plasmadial foi extraído. O sequenciamento foi feito no Sequenciador automático ABI 3730 (Applied Biosystems). Nas sequências, na forma de eletroesferogramas, foram exclídas as regiões referentes ao vetores e adaptadores, analisadas pelos programas "Phred, Phrap, Consed" e agrupadas em contigs. As sequencias consensos foram submetidas à consulta de similaridade com outras sequências já depositadas no banco de dados GenBank através de BLASTn e BLASTx e só foram considerados alinhamentos com e-volue inferior a 10-³. As sequencias do PFGSV evidenciaram similaridade com regiões codificadoras da replicase (rep) e proteína de movimento (mp) do vírus da leprose dos citros (Citrus leprosis virus cytoplasmic type - CiLV-C), membro-tipo do recém-criado gênero Cilevirus e que apresenta morfologia, efeitos citopáticos e vetor semelhantes ao PFGSV. Foram desenhados primers para uma região da mp, que só amplificam amostras sintomáticas para pinta verde. Em conclusão, foram obtidas as primeiras sequências genômicas do PFGSV, o que deverá contribuir para a sua classificação taxonômica e gerar um método confiável para o diagnóstico da doença. MenosO Brasil é o maior produtor mundial de maracujá, cultura essa afetada por um grande número de pragas e doenças. O vírus da pinta verde do maracujazeiro (Passion fruit green spot virus - PFGSV), transmitido pelo ácaro tenuipalpídeo Brevipalpus phoenicis, caracteriza-se pela formação de pequenas manchas verdes em frutos maduros e em folhas senescentes, e lesões necróticas em ramos que podem coalescer, produzindo anelamento e morte da planta. Exames ao microscópio eletrônico de transmissão (MET) revelam a presença de partículas baciliformes em cisternas do retículo endoplasmático e viroplasma denso no citoplasma. O diagnóstico da pinta verde é feito através dos sintomas típicos (o que é pouco confiável) ou de exames ao MET (o que é demorado e de alto custo) uma vez que que não estão disponíveis antissoros ou primers para teste sorológicos ou moleculares. Seu controle é essencialmente preventivo através do manejo químico do ácaro. Sendo assim, o objetivo desse trabalho foi sequenciar parcialmente o genoma do vírus a fim de obter subsídios para classificá-lo taxonomicamente, bem como desenvolver um método rápido e confiável para o diagnóstico da doença. O dsRNA de plantas de maracujá sintomáticas para pinta verde da região de Limeira-SP foi extraído, purificado e avaliado em de gel de agarose 1%. A síntese da 1º fita de cDNA foi realizada utilizando a enzima M-MLV-RT (Invitrogen) e random primers (Invitrogen). A 2º fita foi feita utilizando a enzima DNA Polimerase I (Promega). ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Biblioteca de cDNA; Sequenciamento de vírus. |
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Categoria do assunto: |
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Marc: |
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520 $aO Brasil é o maior produtor mundial de maracujá, cultura essa afetada por um grande número de pragas e doenças. O vírus da pinta verde do maracujazeiro (Passion fruit green spot virus - PFGSV), transmitido pelo ácaro tenuipalpídeo Brevipalpus phoenicis, caracteriza-se pela formação de pequenas manchas verdes em frutos maduros e em folhas senescentes, e lesões necróticas em ramos que podem coalescer, produzindo anelamento e morte da planta. Exames ao microscópio eletrônico de transmissão (MET) revelam a presença de partículas baciliformes em cisternas do retículo endoplasmático e viroplasma denso no citoplasma. O diagnóstico da pinta verde é feito através dos sintomas típicos (o que é pouco confiável) ou de exames ao MET (o que é demorado e de alto custo) uma vez que que não estão disponíveis antissoros ou primers para teste sorológicos ou moleculares. Seu controle é essencialmente preventivo através do manejo químico do ácaro. Sendo assim, o objetivo desse trabalho foi sequenciar parcialmente o genoma do vírus a fim de obter subsídios para classificá-lo taxonomicamente, bem como desenvolver um método rápido e confiável para o diagnóstico da doença. O dsRNA de plantas de maracujá sintomáticas para pinta verde da região de Limeira-SP foi extraído, purificado e avaliado em de gel de agarose 1%. A síntese da 1º fita de cDNA foi realizada utilizando a enzima M-MLV-RT (Invitrogen) e random primers (Invitrogen). A 2º fita foi feita utilizando a enzima DNA Polimerase I (Promega). Após a síntese da 2º fita do cDNA, foi feita uma extração com fenol: clorofórmio para limpeza da amostra e o cDNA obtido foi ligado a adaptadores, amplificado por Nested PCR e purificado em gel LMP 1%. Os fragmentos purificados foram clonados em vetor pJET2.1 (Fermentas) e inseridos em celulas competentes de Escherichia coli da linhagem DH5a por choque térmico. Os clones transformantes foram coletados em microplacas contendo meio CG acrescido de ampicilina e após seu crescimento o DNA plasmadial foi extraído. O sequenciamento foi feito no Sequenciador automático ABI 3730 (Applied Biosystems). Nas sequências, na forma de eletroesferogramas, foram exclídas as regiões referentes ao vetores e adaptadores, analisadas pelos programas "Phred, Phrap, Consed" e agrupadas em contigs. As sequencias consensos foram submetidas à consulta de similaridade com outras sequências já depositadas no banco de dados GenBank através de BLASTn e BLASTx e só foram considerados alinhamentos com e-volue inferior a 10-³. As sequencias do PFGSV evidenciaram similaridade com regiões codificadoras da replicase (rep) e proteína de movimento (mp) do vírus da leprose dos citros (Citrus leprosis virus cytoplasmic type - CiLV-C), membro-tipo do recém-criado gênero Cilevirus e que apresenta morfologia, efeitos citopáticos e vetor semelhantes ao PFGSV. Foram desenhados primers para uma região da mp, que só amplificam amostras sintomáticas para pinta verde. Em conclusão, foram obtidas as primeiras sequências genômicas do PFGSV, o que deverá contribuir para a sua classificação taxonômica e gerar um método confiável para o diagnóstico da doença.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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| Registros recuperados : 28 | |
| 2. |  | ANTONIOLI-LUIZON, R.; LOCALI-FABRIS, E. C.; ASTÚA, J. F.; MACHADO, M. A.; KITAJIMA, E. W. Estudo da variabilidade genética do vírus da pinta verde do maracujazeiro através de SSCP (Single Strand Conformational Polymorphism). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 25., 2009, Porto de Galinhas, PE. Anais... [São Paulo]: Sociedade Bras. de Microbiologia, 2009. Resumo I - Virologia (Divisão P).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 6. | | PEREIRA, J. A.; ANTONIOLO-LUIZON, R.; LOCALI-FABRIS, E. C.; KUBO, K. S.; MACHADO, M. A.; FREITAS-ÁSTUA, J. Estudo da variabilidade genética da possível capa protéica do Citrus leprosis virus virus C (CiLV-C) em espécies de citros de 14 estados brasileiros. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 34, ago. 2009. Suplemento. Edição dos Resumos do XLII Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Rio de Janeiro, ago. 2009. Suplemento. Resumo 928.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 7. | | KITAJIMA, E. W.; CALEGARIO, R. F.; LOCALI-FABRIS, E. C.; NOVELLI, V. M.; BASTIANEL, M.; FREITAS-ASTÚA, J.; FRANCISCHINI, F. In situ detection of CiLV-C in the mite vector Brevipalpus phoenicis, evidence for a circulative type of virus/vector relationship and a model for the virus circulation in the mite. Tropical Plant Pathology, Brasilia, DF, v. 33, supl., ago. 2008.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 8. | | KITAJIMA, E. W.; CALEGARIO, R. F.; NOVELLI, V. M.; LOCALI-FABRIS, E. C.; BASTIANEL, M.; FRANCISCHINI, F.; FREITAS-ASTUA, J. In situ detection and immunolocalization of the Citrus leprosis virus cytoplasmic type (CiLV) in the mite vector and evidences that the virus/vector relationship is of circulative type. In: INTERNATIONAL SCIENTIFIC SEMINAR ON PLANT HEALTH, 6.; LATIN AMERICAN AND CARIBBEAN SYMPOSIUM, 2., 2008, La Habana, Cuba. Acarina Biodiversity: their use, protection and conservation. Havana, [s.n.], 2008. 1 CD ROM| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 9. | | PEREIRA, J. A.; ANTONIOLI - LUIZON, R.; NICOLINI, F.; LOCALI-FABRIS, E. C.; KUBO, K. S.; M ACHADO, M. A.; FREITAS-ASTÚA, J. Análise da variabilidade genética do gene da capa protéica do vírus da leprose dos citros. Tropical Plant Pathology, Brasilia, DF, v. 33, supl., p. 287, ago. 2008.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 10. | | ASTUA, J. de F.; KITAJIMA, E. W.; KUBO, K. S.; BASTIANEL, M.; CRISTOFANI-VALY, M.; LOCALI-FABRIS, E.; NOVELLI, V. M.; MACHADO, M. A. The atypical Brevipalpus-transmitted viruses and their interactions with host plants and mite vectors. In: EMBO WORLD LECTURE COURSE VIRUS-HOST: PARTNERS IN PATHOGENICITY, 2010, San Jose. [Abstracts...].San Jose: EMBO, 2010. p. 40. Organizado por Cecilia Ramirez.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 11. | | NOVELLI, V. M.; FREITAS-ASTUA, J.; RIBEIRO, B. M.; LOCALI-FABRIS, E. C.; NAVIA, D.; KITAJIMA, E. W.; MACHADO, M. A. Prevalence of the Cardinium symbiont and genetic variability of Brevipalpus phoenicis (Acari: Tenuipalpidae) populations from Brazil. In:INTERNATIONAL CONGRESS OF ACAROLOGY, 13., 2010, Recife. Abstracts book... Recife: CNPq: FACEPE: Banco do Nordeste: TWAS, 2010. p. 181-182. Abstract 335| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 12. | | NOVELLI, V. M.; FREITAS-ASTÚA, J.; LOCALI-FABRIS, E.; KITAJIMA, E. W.; HILF, M. E.; GOTTWALD, T. R.; MACHADO, M. A. Prevalence and genetic variability of the Cardinium symbiont of Brevipalpus phoenicis (Acari: Tenuipalpidae) populations from Brazil. In: EUROPEAN CONGRESS OF ACAROLOGY INTEGRATIVE ACAROLOGY, 6., Montpellier. Abstracts... Montpellier: EURAAC, 2008. p. 59.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 13. | | KUBO, K. S.; STUART, R. M.; FREITAS-ASTÚA, J.; ANTONIOLI-LUIZON, R.; LOCALI-FABRIS, E. C.; COLETTA-FILHO, H. D.; MACHADO, M. A.; KITAJIMA, E. W. Evaluation of the genetic variability of orchid fleck virus by single-strand conformational polymorphism analysis and nucleotide sequencing of a fragment from the nucleocapsid. Archives of Virology, v. 154, n. 6, p. 1009-1014, mai. 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 14. | | LOCALI-FABRIS, E. C.; MAFRA, V. S.; MARTINS, P. K.; RIBEIRO- ALVES, M.; FRANCISCO, C. S.; FREITAS ASTUA, J. de; KISHI, L. T.; MACHADO, M. A. Gene set enrichment analysis in sweet orange plants infected by Candidatus Liberibacter americanus. In: CONFERENCE INTERNATIONAL ORGANIZATION CITRUS VIROLOGISTS, 18., Campinas, SP, 2010. Proceedings... Campinas: IOCV, 2010. 1 CD-ROM. 0058 PSO
Publicado também em: Citrus Research & Technology, Cordeirópolis, v. 31, Suplemento, 2010| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 15. | | NICOLINI, F.; BASTIANEL, M.; SCHONS, J.; KITAJIMA, E. W.; LOCALI-FABRIS, E. C.; PEREIRA, J. A.; KUBO, K. S.; NOVELLI, V. M.; MACHADO, M. A.; FREITAS-ASTÚA, J. Comparação entre os títulos de vírus transmitidos por ácaros Brevipalpus por RT-qPCR. Tropical Plant Pathology, Brasilia, DF, v. 33, supl., ago. 2008.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 16. | | FREITAS-ÁSTUA, J.; BASTIANEL, M.; LOCALI-FABRIS, E. C.; NOVELLI, V. M.; SILVA-PINHATI, A. C.; BASÍLIO-PALMIERI, A. C.; TARGON, M. L. P. N.; MACHADO, M. A. Differentially expressed stress-related genes in the compatible citrus-Citrus leprosis virus interaction. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 30, n. 3, p. 980-990, 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
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| 17. | | NOVELLI, V. M.; ASTUA, J. de F.; LOCALI-FABRIS, E. C.; BASTIANEL, M.; ANTONIOLI-LUIZON, R.; RIBEIRO, B. M.; MACHADO, M. A. Detecção do vírus da leprose dos citros no ácaro vetor. Laranja, Cordeiropólis, v. 28, n. 1/2, 2007 Disponível em: Acesso em: 26 out. 2010.
Pdf: 04_313 desenvolvimento [1]. pdf
Secção: Fitopalogia| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
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| 18. | | COSTA, F. M.; FREITAS-ASTUA, J.; BASTIANEL, M.; LOCALI-FABRIS, E.; MACHADO, M. A.; KUBO, K. S.; GONDIM JÚNIOR, M. G. C.; NOVELLI, V. M.; PEREIRA, J. A. Detecção do vírus da mancha anelar do cafeeiro (CoRSV) nas diferentes fases do ácaro vetor Brevipalpus phoenicis. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 34, ago. 2009. Suplemento. Edição dos Resumos do XLII Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Rio de Janeiro, ago. 2009. Suplemento. Resumo 919.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 19. | | KUBO, K. S.; NOVELLI, V. M.; BASTIANEL, M.; LOCALI-FABRIS, E. C.; ANTONIOLI-LUIZON, R.; MACHADO, M. A.; FREITAS-ASTUA, J. Detection of Brevipalpus-transmitted viruses in their mite vectors by RT-PCR. Experimental Applied Acarology, Dordrechet, v. 54, n. 1, jan. 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 20. | | CALEGARIO, R. F.; KITAJIMA, E. W.; LOCALI-FABRIS, E. C.; SALAROLI, R. B.; FREITAS-ASTÚA, J.; STACH- MACHADO, D. R.; CASERTA, R.; MACHADO, M. A. In situ immunocytochemistry of citrus leaves infected with Citrus leprosis virus cytoplasmic type (CiLV-C). Tropical Plant Pathology, Brasilia, DF, v. 33, supl., ago. 2008.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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